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研華攜手偉薩科技發布一體化DNA基因排序加速解決方案

  2019年04月18日  

  全球知名的工業物聯網解決方案提供商研華科技近日宣布發布與偉薩科技技術共同創建的DNA基因排序加速解決方案。該解決方案解決了大中華區和北美地區對非侵入性產前檢查(NIPT)和癌癥和疾病診斷市場日益增長的需求。

  “下一代測序(NGS)”是近年來備受關注的基因技術。通過比較和分析DNA序列,NGS根據人類基因組數據庫精確定制治療方案。NGS通過定位存儲與潛在原因相關的信息來幫助醫療人員防止傳播和感染,對抗癌癥和罕見疾病。然而,產生了一個問題,基因服務提供者面臨著越來越大的挑戰:處理無休止的基因組數據。這個耗時耗力的過程阻礙了研究和進展。

  為了應對這一挑戰,研華科技與偉薩科技,一家專長在基因組測序加速的臺灣公司,共同開發了一種加速解決方案。通過將研華SKY-7210服務器與偉薩科技的FPGA卡相結合,專為精密醫療行業設計出一種優化和加速數據處理的基因測序一體式服務器。

  借助這個高速平臺,種系分析管道處理時間最多可縮短25小時,從近33小時縮短到不足8小時,從而大大提高了效率并降低了TCO(總經營成本)。該基因排序加速解決方案現在已經在研究機構、生物庫、診所和醫院開始使用,在基因組數據分析方面提供了更大的靈活性,并提升了精確醫學的價值。

  基因排序加速解決方案

  基因排序加速解決方案提供一個無痛的升級過程,使用本地BWA-MEM和GATK處理種系管道的二次分析。使用者可以在不更改工作流的情況下完成對齊、排序、標記復制和變量調用的分析。隨著本機快速算法的加速,SNPs和INDELs的整體精度為99.9%,與原始軟件相同。此外,加速解決方案提供與原始軟件完全相同的輸出文件格式。

  基因排序加速解決方案為在服務器上部署大數據和深度學習提供了一個平臺,該服務器具有3TB DDR4插槽、3 x NMC(網絡夾層卡)和2 x 300W GPU或6 x 150W GPU,以減少從HDD到FPGA的數據移動延遲。連接更靈活,更容易適應未來的擴展。

標簽:研華我要反饋
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